MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori F30 plasmid pHPF30

Total Repeats: 79

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017369	A	6	6	12	17	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017369	CAA	2	6	46	51	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017369	CAA	2	6	112	117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017369	CAT	2	6	128	133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017369	TTTCT	2	10	365	374	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_017369	TG	3	6	398	403	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017369	T	6	6	410	415	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017369	GGT	2	6	431	436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017369	AAT	2	6	440	445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017369	T	7	7	448	454	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017369	TAAC	2	8	2753	2760	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017369	ATA	2	6	2878	2883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017369	AAT	2	6	2886	2891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017369	T	7	7	2897	2903	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017369	TAA	2	6	2924	2929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017369	T	6	6	2932	2937	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017369	A	6	6	2994	2999	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017369	T	6	6	3004	3009	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017369	TG	3	6	4731	4736	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017369	TG	3	6	4774	4779	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017369	TGAG	2	8	4879	4886	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017369	AG	4	8	4885	4892	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017369	TTAG	2	8	4903	4910	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017369	TAAC	2	8	5021	5028	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017369	GTT	2	6	5043	5048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017369	ATTG	2	8	5052	5059	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017369	TTA	2	6	5105	5110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017369	GATTT	2	10	5128	5137	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017369	ATT	2	6	5140	5145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017369	T	6	6	5197	5202	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017369	TTG	2	6	5208	5213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017369	AG	3	6	5237	5242	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017369	T	7	7	5270	5276	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017369	TGTTT	2	10	5364	5373	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017369	G	8	8	5399	5406	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017369	GATT	2	8	5509	5516	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017369	A	6	6	5662	5667	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017369	AAGA	2	8	5704	5711	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017369	AG	3	6	5759	5764	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017369	AG	3	6	5820	5825	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017369	GCT	2	6	5903	5908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017369	TGA	2	6	5909	5914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017369	AGT	2	6	5915	5920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017369	ACA	2	6	5933	5938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017369	ACA	2	6	6046	6051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017369	GTT	2	6	6086	6091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017369	TTC	2	6	6102	6107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017369	GAAT	2	8	6121	6128	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017369	ATC	2	6	6150	6155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017369	TGAA	2	8	6162	6169	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017369	ATT	2	6	6197	6202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017369	AAC	2	6	6245	6250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017369	C	6	6	6336	6341	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
54	NC_017369	CTAAAA	2	12	6548	6559	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_017369	GTT	2	6	6587	6592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017369	TTA	2	6	6594	6599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017369	GC	4	8	6641	6648	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017369	CTT	2	6	6732	6737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017369	ATAAC	2	10	6745	6754	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_017369	ATAAC	2	10	6767	6776	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_017369	ATAAC	2	10	6789	6798	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_017369	TTAT	2	8	6821	6828	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017369	ATT	2	6	6841	6846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017369	AAC	2	6	6866	6871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017369	GTGG	2	8	6958	6965	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017369	AGG	2	6	6975	6980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017369	TAG	2	6	7003	7008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017369	TAA	2	6	7060	7065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017369	CCG	2	6	7077	7082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_017369	ATGC	2	8	8798	8805	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017369	GAAA	2	8	8835	8842	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017369	CAAAT	2	10	8877	8886	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_017369	GAAG	2	8	8910	8917	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017369	A	7	7	8974	8980	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017369	TGA	2	6	8996	9001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017369	ATCA	2	8	9015	9022	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017369	CTTG	2	8	9041	9048	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_017369	A	6	6	9104	9109	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017369	TGA	2	6	9119	9124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.